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1.樣本間交叉污染：收集樣本的容器被污染或樣本密封不嚴(yán)導(dǎo)致外溢；不同樣本移液時(shí)忘記更換槍尖或未使用帶濾芯槍尖；移液器等實(shí)驗(yàn)器具及耗材未及時(shí)消毒滅菌；不同樣本同時(shí)開(kāi)蓋或樣本劇烈震蕩、反復(fù)吹吸導(dǎo)致氣溶膠形成擴(kuò)散，相互交叉污染。

2.實(shí)驗(yàn)試劑污染：主要是在 PCR 組分試劑加樣過(guò)程中，由于移液器、容器、陰性對(duì)照及其它試劑被核酸模板或陽(yáng)性對(duì)照污染。加樣過(guò)程中，因?yàn)镻CR試劑對(duì)溫度十分敏感，需要通過(guò)冰浴使得PCR試劑和PCR板/管處于0℃，但這個(gè)過(guò)程也充滿污染風(fēng)險(xiǎn)。

3.擴(kuò)增產(chǎn)物污染：大量拷貝的產(chǎn)物泄漏或擴(kuò)增后的PCR反應(yīng)管意外開(kāi)蓋，這是PCR反應(yīng)中最主要、最常見(jiàn)的污染問(wèn)題。因?yàn)镻CR產(chǎn)物拷貝量大，遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于PCR檢測(cè)數(shù)個(gè)拷貝的極限，所以極微量的PCR產(chǎn)物污染，就可形成假陽(yáng)性。

4.克隆質(zhì)粒污染：作為陽(yáng)性質(zhì)控品的克隆質(zhì)粒外溢。